熵极限下蛋白质的拉伸
生物大分子
2009-11-10 v1 软凝聚态物质
定量方法
摘要
通过分子动力学模拟研究六种蛋白质的机械拉伸。模型为 Go 类,在天然接触处具伦纳德-琼斯相互作用。低温去折叠情景异常复杂且对微小结构变化敏感。热涨落降低去折叠过程中的峰值力与亚稳态数。去折叠路径也随温度升高而简化。在熵极限下,所有蛋白质均显示随其沿主链的间隔(接触序)而断裂的键的伸展单调下降。
引用
@article{arxiv.q-bio/0311015,
title = {Stretching of Proteins in the Entropic Limit},
author = {Marek Cieplak and Trinh Xuan Hoang and Mark O. Robbins},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0311015},
year = {2009}
}
备注
RevTex, 5 pages, 5 figures, to appear in Phys. Rev. E