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熵极限下蛋白质的拉伸

生物大分子 2009-11-10 v1 软凝聚态物质 定量方法

摘要

通过分子动力学模拟研究六种蛋白质的机械拉伸。模型为 Go 类,在天然接触处具伦纳德-琼斯相互作用。低温去折叠情景异常复杂且对微小结构变化敏感。热涨落降低去折叠过程中的峰值力与亚稳态数。去折叠路径也随温度升高而简化。在熵极限下,所有蛋白质均显示随其沿主链的间隔(接触序)而断裂的键的伸展单调下降。

关键词

引用

@article{arxiv.q-bio/0311015,
  title  = {Stretching of Proteins in the Entropic Limit},
  author = {Marek Cieplak and Trinh Xuan Hoang and Mark O. Robbins},
  journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0311015},
  year   = {2009}
}

备注

RevTex, 5 pages, 5 figures, to appear in Phys. Rev. E