蛋白质的折叠动力学与冷变性
统计力学
2008-11-06 v1
摘要
研究了蛋白质晶格模型的折叠动力学。该模型采用随机能量模型描述链内耦合,并利用从非极性溶质的真实水合模型导出的温度依赖性溶剂化自由能。通过蒙特卡罗模拟计算了相图中链处于天然结构区域的折叠时间。在较宽的溶剂质量范围内,这些折叠时间在冷变性和热变性温度下大致相等。在这两个温度之间,折叠时间达到最大值,因此,在低温下,随着温度降低,链的动力学总是加速。对构象空间随温度变化的研究有助于阐明这一现象。在低温下,它表明系统的活化势垒随温度降低而下降的速度快于温度本身。在高温下,由于势垒高度几乎恒定,势垒与温度之比随温度升高而降低。
引用
@article{arxiv.0811.0664,
title = {Folding Kinetics of Proteins and Cold Denaturation},
author = {Olivier Collet},
journal= {arXiv preprint arXiv:0811.0664},
year = {2008}
}
备注
7 pages, 7 figures