表征蛋白质折叠的构象温度
统计力学
2013-02-13 v2 软凝聚态物质
摘要
我们使用固有结构景观分析了蛋白质折叠过程的分子动力学模拟时间序列，该景观聚焦于系统的构象动力学。引入了固有结构的时间相关能量和熵，并由这些量定义了构象温度。构象温度遵循慢弛豫过程的时间演化，并在系统达到平衡时达到浴温度。我们表明，非平衡系统由两个温度描述，一个用于快速振动，另一个用于慢构象弛豫，而平衡系统仅由一个温度描述。所提出的形式体系广泛适用于具有许多亚稳态的系统。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0609680,
title = {Conformational Temperature Characterizing the Folding of a Protein},
author = {Naoko Nakagawa},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0609680},
year = {2013}
}