中文

蛋白质内部动力学改变至机械转变态的距离

生物物理 2015-06-26 v1

摘要

通过力谱学对多蛋白的机械去折叠揭示了其自由能景观的宝贵见解。去折叠过程的大多数现象学模型为双态和/或一维,蛋白质及其动力学的细节常被归入零力去折叠速率和至转变态的单一距离 xu1Dx_u^{1\textrm{D}}。我们考虑恒力下模型蛋白的整个相空间,并显示距离 xu1Dx_u^{1\textrm{D}} 包含来自探索全多维能景的可观贡献。具有更多自由度的蛋白质预期有更大的 xu1Dx_u^{1\textrm{D}} 值。我们显示外附柔性连接子也贡献于测得的去折叠特征。

关键词

引用

@article{arxiv.physics/0612183,
  title  = {Internal protein dynamics shifts the distance to the mechanical transition state},
  author = {Daniel K. West and Emanuele Paci and Peter D. Olmsted},
  journal= {arXiv preprint arXiv:physics/0612183},
  year   = {2015}
}

备注

4 pages, accepted to Phys Rev E