拉伸单域蛋白：力诱导变性的相图与动力学
软凝聚态物质
2009-10-31 v1 q-bio
摘要
单分子力谱揭示了 titin 中域的变性.我们通过计算基于格子模型的单域蛋白力诱导变性相图,为这些实验提供理论框架.结果表明,二态文件夹在零力时会协同变性,而拉伸非二态文件夹则经由中间体进行.单个分子的拉伸速率存在巨大差异,反映了力诱导变性路径的异质性.拉伸过程以离散的"量化"方式进行.变性动力学对构象极其敏感.变性速率随力 f 指数增长,直至达到由 f=0 时变性障碍决定的峰值.我们将这些结果映射到蛋白质上,与 titin 中 Ig 类域的力诱导变性结果在定性上一致.我们指出,无需添加变性剂时,可利用单分子力谱描绘蛋白质折叠自由能景观.
引用
@article{arxiv.cond-mat/9905355,
title = {Stretching Single Domain Proteins: Phase Diagram and Kinetics of Force-Induced Unfolding},
author = {D. K. Klimov and D. Thirumalai},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/9905355},
year = {2009}
}
备注
12 pages, Latex, 6 ps figures