具有四种构象状态的三分支 DNA 分子的折叠与去折叠
生物物理
2011-06-13 v1 统计力学
摘要
单分子实验为迄今为止通过体相系统测量无法触及的生物过程提供了新的见解。我们报告了一项通过光镊拉伸实验和理论建模，对具有四种构象状态的三分支 DNA 分子动力学的研究。在折叠和去折叠轨迹中，观察到三个与构象状态间不同转变相关的明显力撕裂。通过将跃迁速率理论应用于分子的自由能模型，计算了不同转变的首次断裂力的概率分布。理论预测与实验结果取得了良好的一致性。此外，由于我们对该分子的特定设计，我们发现了一种通过从测量的力跳跃值估计打开碱基对数量来识别永久性磨损分子的有用方法。
引用
@article{arxiv.1106.2038,
title = {Folding and unfolding of a triple-branch DNA molecule with four conformational states},
author = {Sandra Engel and Anna Alemany and Nuria Forns and Philipp Maass and Felix Ritort},
journal= {arXiv preprint arXiv:1106.2038},
year = {2011}
}
备注
17 pages, 12 figures