单分子统计与多聚链解开过渡
软凝聚态物质
2009-11-07 v1 无序系统与神经网络
生物物理
生物大分子
摘要
我们对单应力下双链DNA的机械解开进行了广泛的理论研究。在长链聚合物的极限中，在约10 pN的临界应力值处存在热力学解开过渡, 对于均聚链和随机杂聚链具有不同的临界行为。我们将随机序列DNA的无序平均行为结果推广到更易于实验的单分子解开问题。随着应力接近临界值, 双链DNA以离散的、序列相关的步骤解开, 这些步骤使其逐步到达更深的能量最小值。伸长-应力图因此呈现出一系列由锐利跳跃分隔的平坡的显著形态。类似的定性特征应在蛋白质和折叠RNA分子的显微操作实验中重现。尽管其异常的形态, 单分子的伸长-应力曲线仍揭示了无序平均临界行为的残余。超过转变后, 解开叉的动力学与在随机力场中扩散的粒子有关; 预期在应力超过解开临界值约5 pN之前仍存在异常的、无序主导的行为。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0107423,
title = {Single Molecule Statistics and the Polynucleotide Unzipping Transition},
author = {David K. Lubensky and David R. Nelson},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0107423},
year = {2009}
}
备注
40 pages, 18 figures