DNA 双螺旋解链过程的可能场景
生物物理
2017-02-14 v2
摘要
对 DNA 解链过程的单分子微操作实验分析显示了力-距离曲线的某些特征，即依赖于核苷酸序列结构的 区域内的两个连续平台，以及平台区域内出现的峰值，这些此前未受到足够重视。使用原子-原子势函数方法对 Watson-Crick 碱基对的打开能进行了估算。基于这些结果，提出了 DNA 双螺旋解链过程的两种可能场景。根据第一种场景，DNA 解链作为平衡过程缓慢发生，解链曲线上两个平台之间的差异很小。在这种情况下，碱基对首先沿“打开”路径转变为“预打开”亚稳态，然后沿“拉伸”路径打开。我们的估算表明，实现该场景的一个重要因素是 DNA 未打开部分存在双链 DNA 卷曲。第二种场景的特征是更高的打开力。在该场景中，碱基对作为非平衡过程沿“拉伸”路径直接打开。第一种场景的实现条件表明，它在理解转录和遗传信息传递过程中的体内 DNA 解链方面可发挥关键作用。
引用
@article{arxiv.1702.00559,
title = {Possible scenarios of DNA double helix unzipping process},
author = {O. O. Zdorevskyi and S. N. Volkov},
journal= {arXiv preprint arXiv:1702.00559},
year = {2017}
}