基因组序列对 DNA 分子力诱导解链的影响
软凝聚态物质
2007-05-23 v1 统计力学
摘要
我们考虑了一种双链 DNA 聚合物，其中碱基在碱基对水平上是随机分布的，但在 18 个碱基对的长度上是有序的，并计算了其在恒定伸长系综中的力-伸长行为。发现解链力 与伸长量 的关系曲线具有一系列极大值和极小值。通过在分子中选定位置改变碱基对，我们计算了 曲线的变化，发现力的变化量级为几个 pN，且效应范围取决于温度，可扩展到几个碱基对。我们还简要讨论了如何在恒定力系综中，根据 的知识计算伸长-时间曲线中的暂停或跳跃。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0603365,
title = {Effect of genome sequence on the force-induced unzipping of a DNA molecule},
author = {Navin Singh and Yashwant Singh},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0603365},
year = {2007}
}