单链DNA通过构象变化纳米孔道的穿越
统计力学
2007-05-23 v2 软凝聚态物质
亚细胞过程
摘要
我们利用耦合主方程组研究了单链DNA通过一个在两种构象之间波动的孔道的穿越。计算了穿越过程第一次到达时间（FPT）的概率密度函数，显示出三峰、双峰或单峰行为，取决于构象之间的相互转换速率、施加的电场以及初始条件。在无电场环境下，FPT的累计概率函数显示出两种规模，分别由快速和慢速时间尺度特征。推导了穿越过程平均第一次到达时间的解析表达式，除了相互转换速率外，还对穿越过程进行了广泛表征。讨论了与实验观察的关系。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0308199,
title = {Translocation of a Single Stranded DNA Through a Conformationally Changing Nanopore},
author = {O. Flomenbom and J. Klafter},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0308199},
year = {2007}
}
备注
8 pages, 5 figures, Biophys. J., in press