结构化聚合肠蛋白通过纳米孔的转位
软凝聚态物质
2009-11-10 v2 生物物理
生物大分子
摘要
我们理论上研究了结构化 RNA/DNA 分子通过窄孔道的转位过程。该孔道仅允许单链通过而不允许双链通过。分子内部配对区域的解链带来显著的动力学阻力。我们指出，这一情况可被利用来确定聚合肠蛋白的完整配对模式，包括 RNA 伪环结构。关键要求是需要以空间分辨率为几碱基的时间函数记录转位动力学（即转位分子片段的长度）。这可以通过例如施加机械驱动力并记录原子力显微镜或光学捕托装置的力-伸长曲线（FEC）来实现。我们的分析表明，凭借此额外的空间分辨率，纳米孔可被转化为研究核酸折叠的强大实验工具。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0306126,
title = {Translocation of structured polynucleotides through nanopores},
author = {Ulrich Gerland and Ralf Bundschuh and Terence Hwa},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0306126},
year = {2009}
}
备注
9 pages, 5 figures