RNA 通过纳米孔的转位动力学

我们提出一个 RNA 通过纳米孔转位动力学的简化模型，该孔仅允许未结合核苷酸通过。具体地，我们将动力学约化为随机 walker 在一维转位自由能景貌上的运动，由此考虑随机双组分单链核苷酸的无序平均转位动力学。这些转位景貌由 RNA 序列的折叠及纳米孔两端所加电压偏置算出。我们针对 1500 条长度为 4000 的随机双字母序列计算这些景貌。在这些景貌上的动力学模拟显示出异常特征，类似于随机作用力能量景貌：在纳米孔两端电压偏置足够小时转位过程比时间线性更慢，而在大电压偏置下随时间线性进行。我们认为简化模型给出了更真实转位动力的上界，故预期所有 RNA 转位模型均会呈现异常区间。