结构化异聚物的纳米孔易位反常标度
生物大分子
2009-05-04 v1
摘要
通过纳米孔的易位是一种探测生物分子物理性质的新实验技术。关于单个无结构分子的易位时间对分子长度的依赖关系，已有大量的理论和计算研究。在此，我们研究同样的问题，但针对的是 RNA 分子，其二级结构的解离是易位的主要势垒。为此，我们计算了许多随机选择的 RNA 序列在零厚度纳米孔和零电压下单链 RNA 的平均易位时间。我们发现易位时间以幂律形式依赖于 RNA 分子的长度。该指数随温度变化，并且在所有温度下均超过纯扩散输运朴素预期的指数 2。我们用具有对数势垒的一维能量景观中的扩散来解释该幂律标度。
引用
@article{arxiv.0901.4850,
title = {Anomalous scaling in nanopore translocation of structured heteropolymers},
author = {Malcolm McCauley and Robert Forties and Ulrich Gerland and Ralf Bundschuh},
journal= {arXiv preprint arXiv:0901.4850},
year = {2009}
}
备注
21 pages, 7 figures, 1 table