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受力跨膜迁移的异常动力学

软凝聚态物质 2009-11-10 v1 统计力学 生物大分子

摘要

我们考察了长度为N的长链聚合物通过膜孔隙的迁移过程。若过程缓慢,理论上可聚焦于单侧膜两侧单体数s的动力学,假设两段区域处于平衡状态。在此极限下,s(t)的动力学为扩散过程,无外力时的平均跨膜时间随N^2呈线性,施加力后与N成正比。我们证明,对于足够长的聚合物(尤其是受力时),平衡假设必然失效,并通过与无阻力运动比较,给出跨膜时间的下界。这些下界超过基于平衡计算的尺度,指向跨膜动力学呈异常(亚扩散)特征。这一点通过对无力迁移的自避聚合物数值模拟得到明确验证。受力跨膜时间显著取决于力的施加方式。特别是,通过末端拉力会导致远长于在膜两侧施加化学势差时的跨膜时间。这些情况下,下界分别随N^2和N^{1+nu}增长,其中nu为半径尺度与N关系的幂律指数。我们的模拟显示,实际跨膜时间的尺度与下界一致,尽管存在强烈有限大小效应,即使我们考虑的最长聚合物(N=512)也如此。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/0310521,
  title  = {Anomalous Dynamics of Forced Translocation},
  author = {Yacov Kantor and Mehran Kardar},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0310521},
  year   = {2009}
}

备注

13 pages, RevTeX4, 16 eps figures