RNA拉伸实验的热力学与动力学方面

近期的单分子拉伸实验展示了如何利用光镊力显微镜操控RNA分子。我们研究了一个实验装置的最小模型，该模型包括一个RNA分子、连接的两个聚合物（手柄）以及一个被捕获在光势阱中并附着于其中一个手柄的微珠。最初，我们关注以协同方式展开的小型单结构域RNA分子。该模型定性地再现了实验结果，并使我们能够研究微珠和手柄对展开反应的影响。我们模型的一个主要成分是考虑适当的统计系综以及描述系统中热涨落的相应热力学势。然后，我们研究了从实验数据中提取热力学信息相关的几个问题。接下来，我们使用动力学模型研究动力学。最后，我们探讨了具有 $Mg^{2+}$ 三级接触并以顺序方式展开的多结构域RNA分子的更一般问题，并提出了分析断裂力数据以获得表征每个结构域的可靠动力学参数的技术。