RNA的机械解折叠：从发夹到含内部多环的结构
生物大分子
2009-11-13 v1 软凝聚态物质
生物物理
定量方法
摘要
利用激光光镊（LOT）实验对从发夹到核酶等RNA结构进行的机械解折叠，已开始揭示常规实验不易探索的能量景观特征。施加恒力（）时，RNA发夹经历从折叠到解折叠状态的协同转变，而核酶的亚结构域则逐个解开。在此，我们使用自组织聚合物（SOP）模型和布朗动力学模拟来探究四种不同复杂度RNA结构在恒力与恒加载速率下的机械解折叠。我们的工作表明（i）RNA对力的响应很大程度上由天然结构决定；（ii）只有在宽力范围内探测机械解折叠，才能充分探索底层能量景观。
引用
@article{arxiv.q-bio/0609029,
title = {Mechanical unfolding of RNA: From hairpins to structures with internal multiloops},
author = {Changbong Hyeon and D. Thirumalai},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0609029},
year = {2009}
}
备注
26 pages, 6 figures, Biophys. J. (in press)