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RNA 次级结构形成:离聚体折叠的可求解模型

统计力学 2009-10-31 v1 软凝聚态物质 生物物理 生物大分子

摘要

我们在 RNA 次级结构的背景下研究了离聚体结构形成的统计力学。采用一种能量偏向于特定本征结构(棒形结构)的设计 RNA 序列,以研究 RNA 在温度函数下的本征相与熔融相之间的相变。该相变由聚合体与本征结构重合所获得的能量增益与形成随机接触所获得的熵增益之间的竞争所驱动。提出并精确求解了一个简化的类 Go 模型。通过对大量类似设计序列的精确数值枚举验证了预测的临界行为。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/9903089,
  title  = {RNA secondary structure formation: a solvable model of heteropolymer folding},
  author = {R. Bundschuh and T. Hwa},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/9903089},
  year   = {2009}
}

备注

4 pages including 2 figures