随机RNA二级结构在玻璃化转变附近的行为
生物大分子
2019-03-04 v2 无序系统与神经网络
统计力学
摘要
RNA通过分子内碱基配对形成精细的二级结构。这些结构在每个细胞内执行关键的生物学功能。由于存在一种多项式算法来计算这些结构上的配分函数，它们也是研究无序系统统计物理的合适系统。在该模型中，在变性温度以下，随机RNA二级结构存在于两种相之一：强无序的低温玻璃相，以及弱无序的高温熔融相。两个碱基配对的概率随其距离衰减，在熔融相中指数为3/2，在玻璃相中约为4/3。受先前分离两相的玻璃化转变重正化场论结果的启发，我们对这一转变进行了数值研究。我们为每一相引入了不同的序参量，它们在临界点均趋于零。我们最终探讨了该转变背后的驱动机制。
引用
@article{arxiv.1808.02351,
title = {On the behavior of random RNA secondary structures near the glass transition},
author = {William D. Baez and Kay Jörg Wiese and Ralf Bundschuh},
journal= {arXiv preprint arXiv:1808.02351},
year = {2019}
}