具有环熵和淬火无序的 RNA 二级结构的冷变性
生物物理
2020-02-05 v1 软凝聚态物质
生物大分子
摘要
我们通过约束退火方法研究了具有淬火序列随机性的 RNA 二级结构的折叠。通过引入环构象的权重诱导了热力学相变。除了预期的高温熔化外，还出现了冷熔化转变。我们的结果表明，实验上发现的 RNA 冷变性实际上是由淬火序列无序触发的连续相变。针对有利与不利碱基对之间的竞争能量情形，我们计算了热熔化和冷熔化的临界温度，并给出了作为环指数和温度函数的相图。
引用
@article{arxiv.1810.02633,
title = {Cold denaturation of RNA secondary structures with loop entropy and quenched disorder},
author = {Flavio Iannelli and Yevgeni Mamasakhlisov and Roland R. Netz},
journal= {arXiv preprint arXiv:1810.02633},
year = {2020}
}