蛋白次级结构的热折叠与机械拉伸路径
软凝聚态物质
2007-05-23 v1 生物大分子
摘要
通过分子动力学模拟对Go类模型中的次级结构进行机械拉伸研究。拉伸装置的刚度与速度对力-位移曲线有显著影响。拉伸事件的发生顺序(即接触断裂的次序)被与热折叠与未折叠过程中的事件序列进行比较。发现α-螺旋和β-发夹结构之间的相反相关。对于两个α-螺旋的叠联体,两个次级结构几乎同时解绳。提出了重复单元同时 vs. 顺序解绳的简单条件。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0112200,
title = {Thermal Folding and Mechanical Unfolding Pathways of Protein Secondary Structures},
author = {Marek Cieplak and Trinh Xuan Hoang and Mark O. Robbins},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0112200},
year = {2007}
}
备注
12 pages, 17 figures