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RNA解链中的动力学势垒

生物大分子 2009-11-10 v1 软凝聚态物质 生物物理

摘要

我们考虑一个关于RNA三级结构在动态加载下展开的简模型。此类结构的打开被视为一个两步过程,每一步对应于克服单个能量势垒。所得双势垒能量景貌解释了展开动力学对拉伸速率的依赖性。此外在中等力下,通过分析打开动力学无法区分两个势垒,其表现为受单个宏观势垒主导,该宏观势垒的性质以非平凡方式依赖于两个单独势垒。我们的结果表明,在含三级结构的RNA分子的拉伸实验中,单个动力学势垒的细节只能在低拉伸速率值或高力 regime 下获得。

关键词

引用

@article{arxiv.q-bio/0405017,
  title  = {Kinetic barriers in RNA unzipping},
  author = {Alberto Imparato and Luca Peliti},
  journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0405017},
  year   = {2009}
}

备注

to appear on Eur. Phys. J. B