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统一单分子过程的热力学与动力学描述:张力下的 RNA 解折叠

统计力学 2007-09-18 v1 软凝聚态物质

摘要

我们利用介观非平衡热力学理论来描述张力下的 RNA 解折叠。该理论引入了反应坐标,用于表征分子中每个键的连续状态谱。所考虑的解折叠过程非常缓慢,以至于可以假设在反应坐标空间中存在局部平衡。在高序列势垒的准稳态极限下,我们的理论导出了最近提出的序列步进模型的主方程。研究发现开放态与闭合态之间存在非线性开关动力学。我们的理论统一了热力学和动力学描述,并提供了一套系统化的程序来表征解折叠过程的动力学。

关键词

引用

@article{arxiv.0709.2609,
  title  = {Unifying thermodynamic and kinetic descriptions of single-molecule processes: RNA unfolding under tension},
  author = {J. M. Rubi and D. Bedeaux and S. Kjelstrup},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0709.2609},
  year   = {2007}
}

备注

13 pages, 3 figures