力钳条件下蛋白质的解折叠时间
统计力学
2012-01-18 v1 软凝聚态物质
摘要
使用一个β-桶模型研究了在恒定拉伸力作用下蛋白质从天然态谷逃逸的过程。在很宽的力范围内，解折叠动力学可以视为一维扩散，以末端距为参数。特别地，逃逸时间可以视为在蛋白质自由能景观上运动的布朗粒子的首次通过时间，使用Smoluchowski方程进行计算。在强力下，解折叠过程可视为远离天然态的扩散漂移，而在弱力下，热激活是相关机制。在这种方法下的逃逸时间分析揭示了从弱力到强力时，逃逸时间分布从指数分布到逆高斯分布的交叉。此外，可以设计一个在弱力和强力下都有效的单一表达式，用于平均解折叠时间以及相应的方差。该分析为ddFLN4和泛素最近的实验结果提供了一种可能的解释。
引用
@article{arxiv.0909.2500,
title = {Unfolding times for proteins in a force clamp},
author = {Stefano Luccioli and Alberto Imparato and Simon Mitternacht and Anders Irbaeck and Alessandro Torcini},
journal= {arXiv preprint arXiv:0909.2500},
year = {2012}
}
备注
6 pages, 4 figures, submitted for pubblication to Physical Review Letters