力钳制分析技术揭示泛素拉伸指数展开动力学
生物物理
2012-12-07 v1 生物大分子
摘要
力钳制光谱技术揭示了单蛋白分子的展开时间和二硫键断裂时间与拉伸力、点突变及溶剂条件的函数关系。这些时间的统计分布揭示了蛋白结构域是否相互独立、多蛋白链中的力学层级，以及其来源概率分布的函数形式。因此，使用稳健的统计检验来解读该过程背后的正确理论模型至关重要。在此，我们以泛素为例，开发多种技术将既有的实验数据集与现有理论模型进行比较。我们表明，针对滤波的稳健性、与考虑实验伪影的最大似然函数的一致性、Kuiper 统计检验以及与合成数据的吻合，均识别出 Weibull 分布或拉伸指数分布为最佳拟合模型。我们的结果与最近提出的能量景观中的高斯无序或施加力中的噪声作为观测到的非指数动力学解释的模型不一致。由于拟合中的物理模型会影响特征展开时间，这些结果对我们理解蛋白质的生物学功能具有重要意义。
引用
@article{arxiv.1208.3788,
title = {Force-clamp analysis techniques reveal stretched exponential unfolding kinetics in ubiquitin},
author = {Herbert Lannon and Eric Vanden-Eijnden and Jasna Brujic},
journal= {arXiv preprint arXiv:1208.3788},
year = {2012}
}