蛋白质力学解折叠：一个二元变量模型
软凝聚态物质
2007-10-16 v1 生物大分子
摘要
一个简单的格子模型，最近作为 Wako--Saitô 蛋白质折叠模型的推广被引入，被用于研究广泛研究的分子在外力下的性质。基于该模型的精确解，研究了模型蛋白质的平衡性质及其能量景观。随后，考虑了分子对力的动力学响应，讨论了力钳和动态加载方案，并表明与理论预期一致。通过计算机模拟评估了表征蛋白质解折叠的动力学参数，并在有实验结果时与之吻合良好。最后，利用推广的 Jarzynski 等式探讨了通过拉伸实验重构蛋白质自由能景观的可能性。
引用
@article{arxiv.0706.2818,
title = {Protein mechanical unfolding: a model with binary variables},
author = {A. Imparato and A. Pelizzola and M. Zamparo},
journal= {arXiv preprint arXiv:0706.2818},
year = {2007}
}