模型蛋白质的非平衡转变与动力学和热力学转变
软凝聚态物质
2010-07-14 v1 统计力学
摘要
我们识别并研究了非晶格蛋白质模型的平衡和非平衡转变。特别地，研究了蛋白质在机械展开过程中的非平衡动力学，并利用功涨落关系评估了系统的自由能景观。沿着展开路径识别出三种不同的结构转变。此外，基于固有结构形式重构自由能和势能分布，使我们能够将这些转变与蛋白质折叠/展开相关的平衡热转变直接对应起来。通过研究不同温度下蛋白质结构的涨落，我们识别出与蛋白质构型重排相关的动力学转变，这些转变是热转变的前兆。
引用
@article{arxiv.0912.1097,
title = {Out-of-equilibrium versus dynamical and thermodynamical transitions for a model protein},
author = {A. Imparato and S. Luccioli and A. Torcini},
journal= {arXiv preprint arXiv:0912.1097},
year = {2010}
}
备注
Proceedings of the "YKIS 2009 : Frontiers in Nonequilibrium Physics" conference in Kyoto, August 2009. To appear in Progress of Theoretical Physics Supplement