可精确求解的 Ising 类模型的非平衡动力学与蛋白质易位
生物物理
2013-07-26 v1 统计力学
生物大分子
摘要
利用蛋白质机械去折叠的 Ising 类模型，我们在其精确已知的自由能剖面上引入扩散动力学，将该模型的非平衡动力学简化为有偏随机游走。作为示例，该模型随后被应用于蛋白质易位现象，其灵感源自近期关于分子马达牵引绿色荧光蛋白的实验。我们精确评估了平均易位时间，并对单条轨迹的分析表明，易位过程经过一个中间态，这与实验中观察到的情况相似。
引用
@article{arxiv.1307.6687,
title = {Nonequilibrium dynamics of an exactly solvable Ising-like model and protein translocation},
author = {A. Pelizzola and M. Zamparo},
journal= {arXiv preprint arXiv:1307.6687},
year = {2013}
}