蛋白质动力学简正模重构的温度依赖性
统计力学
2015-05-13 v1 生物大分子
摘要
简正模分析是一种广泛使用的技术，用于从天然结构知识重构蛋白质的构象变化。在本快报中，我们研究了在从接近 T=0 到高于解折叠温度范围内，简正模在多大程度上捕捉了动力学的显著特征。我们表明，一方面，只要蛋白质是协同的，在生理温度下使用简正模是合理的。另一方面，为了消除单模贡献对蛋白质涨落的不可预测的温度依赖性，必须考虑多个模。
引用
@article{arxiv.0810.4771,
title = {Temperature dependence of normal mode reconstructions of protein dynamics},
author = {Francesco Piazza and Paolo De Los Rios and Fabio Cecconi},
journal= {arXiv preprint arXiv:0810.4771},
year = {2015}
}