影响蛋白质折叠能力的因素

我们证明了，在简单立方格点上受蒙特卡洛动力学支配的蛋白质异聚物模型的折叠能力，与天然态和结构上不相似的部分谱之间的能隙密切相关。我们考虑了一些无需模拟即可确定的能隙估计值，包括对于具有完全紧密天然态的序列，其天然态和第一激发完全紧密态之间的能量间隙。发现这些估计值比需要模拟评估的参数 $\sigma$ 更能稳健地预测折叠能力：$\sigma = 1 - T_f/T_\theta$，其中 $T_f$ 是序参量涨落最大时的温度，$T_\theta$ 是比热最大时的温度。我们表明，将 $T_\theta$ 解释为塌缩转变温度通常是不正确的，并且 $\sigma$ 与折叠能力之间的相关性源于 $\sigma$ 本质上是对能隙的一种度量。