双磷酸化中多稳态的动力学参数空间
分子网络
2020-04-15 v2 代数几何
动力系统
摘要
分子系统中的多稳态是细胞决策中开关式响应的基础。判定系统是否及何时呈现多稳态一般而言是困难问题。本工作中我们完整确定了参与细胞信号传导的普遍基序——即双磷酸化循环——中_enable 多稳态的动力学参数集合。此外我们证明多稳态与单稳态区域均为道路连通。我们通过源于质量作用定律的参量化多项式常微分方程（ODE）系统对蛋白质浓度随时间的动力学建模。由于该系统具有由底物与两种酶的总量定义的三个线性首次积分，我们研究在适当选取总量后，ODE 系统在哪些参数值下至少有两个正稳态。我们采用了一套（实）代数几何技术，特别涉及正象限上多元多项式符号以及非负回路多项式之和的研究。
引用
@article{arxiv.2001.08285,
title = {The kinetic space of multistationarity in dual phosphorylation},
author = {E. Feliu and N. Kaihnsa and T. de Wolff and O. Yürük},
journal= {arXiv preprint arXiv:2001.08285},
year = {2020}
}