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双磷酸化中单稳态空间的实证探索

最优化与控制 2024-09-25 v1 代数几何

摘要

双磷酸化网络提供了细胞内信号传导的重要组成部分,影响表型的表达与细胞代谢。对于特定的动力学参数选择,该系统表现出多稳态性,这一性质与细胞的决策相关。确定哪些反应速率常数对应于单稳态,哪些产生多稳态,是一个开放问题。系统的单稳态与一个特定多项式的非负性相关。Feliu 等人先前的一项研究通过将该多项式分解为非负电路多项式,提供了单稳态的充分条件。然而,这种分解并非唯一的。我们通过一种系统的方法对双磷酸化网络中此类分解进行分类,从而扩展了他们的工作。利用这一结果分类,我们通过实证实验对非负电路多项式的分解进行了定性比较,并改进了先前关于单稳态区域的条件。

关键词

引用

@article{arxiv.2409.16234,
  title  = {Empirically Exploring the Space of Monostationarity in Dual Phosphorylation},
  author = {May Cai and Matthias Himmelmann and Birte Ostermann},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2409.16234},
  year   = {2024}
}

备注

20 pages, 9 figures, 2 tables