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$n$ 位点磷酸化网络的多稳态参数区域

分子网络 2023-03-07 v2 代数几何 动力系统

摘要

多位点磷酸化是一种众所周知的信号传导机制,能够产生多个稳态,这一特性称为多稳态。当磷酸化以顺序和分配方式进行时,我们得到一个由磷酸化位点数 nn 索引的网络族。本工作通过聚焦于该区域在动力学参数集上的投影,致力于理解该网络族展现多稳态的参数区域。该问题在实代数几何的背景下被提出,并归结为研究一个多项式(定义为大小为三的参数矩阵的行列式)在正象限上是否取得负值。该多项式的系数是动力学参数的函数。对于任意 nn,我们提供了该多项式为正从而排除多稳态的充分条件,以及该多项式取得负值从而允许多稳态的充分条件。这些条件是通过利用多项式的结构、其 Newton 多胞体以及使用电路多项式推导出来的。我们结果的一个重要推论是,对于所有 nn,允许多稳态和排除多稳态的动力学参数集都是连通的。

关键词

引用

@article{arxiv.2206.08908,
  title  = {Parameter region for multistationarity in $n-$site phosphorylation networks},
  author = {Elisenda Feliu and Nidhi Kaihnsa and Timo de Wolff and Oğuzhan Yürük},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2206.08908},
  year   = {2023}
}

备注

23 pages