蛋白质在平衡状态下的构型
统计力学
2009-11-07 v1 软凝聚态物质
生物大分子
摘要
我们提出了一种用于已知本构态结构的蛋白质平衡研究的简单方法。我们以在已知的球状蛋白:Chymotrypsin Inhibitor (2ci2)、Barnase 和 alpha spectrin SH3 域为例,对方法进行测试,并提出在降低温度时层次性秩序开始发生的证据,即使在较高温度下局部层次也具有显著的组织。进一步应用于 HIV-1 蛋白酶的折叠过程显示,该模型可可靠地用于识别负责开发药物抗性的关键折叠位点。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0107624,
title = {Conformations of Proteins in Equilibrium},
author = {Cristian Micheletti and Jayanth Banavar and Amos Maritan},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0107624},
year = {2009}
}
备注
6 pages, 3 eps figures