HIV-1 蛋白酶的分子动力学研究：药物耐药性与折叠路径
统计力学
2007-05-23 v1 软凝聚态物质
生物大分子
摘要
HIV-1 蛋白酶的药物耐药性涉及蛋白中多个位点的累积突变。本文通过分子动力学模拟研究这些突变的作用，利用本态构象对折叠过程的影响。我们的计算表明，贡献于 FDA 批准药物抗药性的位点，是部分折叠状态稳定性最敏感的位置，应在折叠过程中发挥关键作用。此外，我们展示了在药物治疗下发生突变的氨基酸位点之间的关联是统计上相关的。我们的计算与临床数据之间的显著相关性，表明这一方法可用于设计药物，这些药物不仅针对蛋白功能至关重要的区域，还针对折叠过程中的关键区域。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0101229,
title = {Molecular Dynamics Studies on HIV-1 Protease: Drug Resistance and Folding Pathways},
author = {Fabio Cecconi and Cristian Micheletti and Paolo Carloni and Amos Maritan},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0101229},
year = {2007}
}
备注
Revtex, 14 pages, 7 eps figures. Proteins, Structure Function and Genetics, in press (2001)