从自然进化约束中识别 HIV 耐药突变
种群与进化
2016-02-24 v1 生物物理
摘要
人类免疫缺陷病毒（HIV）以非凡的速度进化。然而，其进化受到其适应度景观中突变间相互作用的约束。本文我们展示了一个描述这些相互作用的伊辛模型，该模型从抗逆转录病毒药物使用前获得的序列数据推断而来，可用于识别临床上重要的耐药突变位点。对耐药位点的成功预测表明，在单残基水平上构建真实病毒进化的成功模型取得了进展，并提示我们的方法可用于帮助设计不易失败的新疗法，即使在尚无耐药数据的情况下。
引用
@article{arxiv.1508.01469,
title = {Identification of drug resistance mutations in HIV from constraints on natural evolution},
author = {Thomas C. Butler and John P. Barton and Mehran Kardar and Arup K. Chakraborty},
journal= {arXiv preprint arXiv:1508.01469},
year = {2016}
}
备注
5 pages, 3 figures