不可逆演化、适应度地形中的障碍与持久性药物抗性
种群与进化
2023-07-28 v1
摘要
我们利用适应度图（或有向立方图）来分析演化可逆性。主要应用为抗微生物药物抗性。可逆的药物抗性已在临床与实验中观察到。若药物抗性依赖于单点突变，则一种可能情形是：在停药后该突变回复为野生型密码子，从而敏感性完全恢复。一般而言，药物暂停并不自动意味着药物抗性的快速消除。即便药物抗性可逆，反向演化的阈值浓度也可能低于正向演化。为从理论层面理解包括阈值不对称性在内的演化可逆性，有必要分析适应度地形中的障碍。我们比较了局部与全局障碍、正向与反向演化的障碍，并猜想有利于正向演化的地形与演化可逆性相关。次优峰与平台均被分析，并就冗余与维度的影响作了若干观察。我们的发现与关于不可逆疟疾药物抗性的实验室研究进行了比较。
引用
@article{arxiv.2307.14550,
title = {Irreversible evolution, obstacles in fitness landscapes and persistent drug resistance},
author = {Kristina Crona},
journal= {arXiv preprint arXiv:2307.14550},
year = {2023}
}