预测 HIV-1 在体内对广谱中和抗体的逃逸动态
种群与进化
2022-10-12 v1
摘要
广谱中和抗体是治疗与预防 HIV-1 感染的极具前景的候选者。此类抗体可在感染者体内暂时抑制病毒载量；然而，病毒常通过进化出抗性的逃逸突变株而反弹。本文利用近期一项临床试验的数据，绘制了 HIV-1 与广谱中和抗体相互作用的体内适应度景观。我们识别出两个在不同宿主间可重复决定病毒繁殖率的适应度因子：抗体剂量与病毒载量。该模型成功预测了抗体治疗期间 HIV-1 的逃逸动态，包括敏感株与耐药株之间特征性的频率更替。该更替由剂量依赖的适应度排序所支配，其源于抗体抗性与无药生长中伴随代价之间的进化权衡。我们的分析表明，抗性—代价权衡曲线可作为抗性进化存在下抗体性能的度量。
引用
@article{arxiv.2008.02547,
title = {Predicting in vivo escape dynamics of HIV-1 from a broadly neutralizing antibody},
author = {Matthijs Meijers and Kanika Vanshylla and Henning Gruell and Florian Klein and Michael Laessig},
journal= {arXiv preprint arXiv:2008.02547},
year = {2022}
}
备注
16 pages, 6 figures