天然蛋白质的天然态优化局部熵
生物大分子
2021-11-29 v1 无序系统与神经网络
摘要
长期以来，人们一直用动力学可及性或热力学稳定性的差异来解释多肽构象作为蛋白质天然态的不同能力。基于近期在无序系统（特别是人工神经网络）研究中引入的物理概念和采样算法的成功应用，我们定量地探索了一个称为局部熵的物理量在多大程度上能够很好地描述模型蛋白质的天然态。在格点模型和蛋白质的全原子表示中，我们能够高效地采样高局部熵状态，并提供了增强稳定性和折叠速率的概念验证。我们的方法基于简单而通用的统计力学论证，因此我们预期它们具有非常普遍的用途。
引用
@article{arxiv.2111.12987,
title = {Native state of natural proteins optimises local entropy},
author = {Matteo Negri and Guido Tiana and Riccardo Zecchina},
journal= {arXiv preprint arXiv:2111.12987},
year = {2021}
}