蛋白质折叠模型局部平衡动力学的严格结果
统计力学
2007-05-23 v2
摘要
在[M. Zamparo and A. Pelizzola, Phys. Rev. Lett. 97, 068106 (2006)]中发展了一种局部平衡方法，用于简化蛋白质折叠模型的动力学，该模型的平衡热力学是精确可解的。该方法的重要性质是：(i) 自由能随时间减小，(ii) 在无限时间极限下恢复精确平衡，(iii) 平衡速率是精确速率的上界，以及 (iv) 计算复杂度是变量数的多项式。此外，(v) 该方法等价于另一种近似动力学方法：路径概率方法。在本文中，我们给出了上述结果的详细严格证明。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0607118,
title = {Rigorous results on the local equilibrium kinetics of a protein folding model},
author = {Marco Zamparo and Alessandro Pelizzola},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0607118},
year = {2007}
}
备注
25 pages, RevTeX 4, to be published in JSTAT