古人类混合估计量中的偏差
种群与进化
2014-12-23 v1
摘要
本文评估了一类用于估计现代人类中古人类混合比例的方法中存在的偏差。这些方法研究了现代基因组与古人类基因组之间的等位基因共享模式。它们对“幽灵”混合敏感，即当种群从统计模型未承认的来源接收古人类 DNA 时发生的混合。幽灵混合的影响取决于两个因素：分支长度偏差和种群规模偏差。分支长度偏差的发生是因为如果两个种群分离时间较长，给定量的混合会产生更大的影响。种群规模偏差的发生是因为种群规模的差异会扭曲基因谱系中的分支长度。在没有幽灵混合的情况下，这些效应很小。然而，在存在幽灵混合时，它们变得重要。不同的估计量表现出不同的响应模式。增加某个参数可能会使一个估计量膨胀，而使另一个估计量缩小。因此，估计量之间的比较具有信息量。利用此类比较，本文支持了先前的发现，即古人类种群规模较小，且欧洲人除了来自尼安德特人外，很少接收来自其他古人类种群的基因流。本文还指出了关于美拉尼西亚古人类混合估计中的不一致性。
引用
@article{arxiv.1412.6691,
title = {Bias in Estimators of Archaic Admixture},
author = {Alan R. Rogers and Ryan J. Bohlender},
journal= {arXiv preprint arXiv:1412.6691},
year = {2014}
}