利用不平衡数据资源估计跨祖先遗传相关性
统计方法学
2022-03-24 v1
摘要
本文旨在提出一种利用遗传预测观测值估计跨祖先遗传相关性的新估计方法,该相关性描述复杂性状的遗传结构在人群间的差异,应用于全基因组关联研究(GWAS)。我们的新估计量纠正了由高维弱GWAS信号引起的预测误差,同时处理了GWAS数据跨种族的异质性,如连锁不平衡(LD)差异,这在忽略同质性的分析中会导致偏倚结果。此外,我们的估计量仅需一个人群具有较大的GWAS样本量,而第二个人群可仅具有少得多的参与者(例如数百人)。它专门设计用于处理不平衡数据资源,即欧洲人群的GWAS样本量通常大于非欧洲祖先群体。对UK Biobank研究中30个复杂性状的广泛模拟与真实数据分析表明,我们的方法能够为广泛的复杂性状提供可靠估计。我们的结果对人群特异性遗传发现的迁移性提供了深刻见解。
引用
@article{arxiv.2203.12154,
title = {Estimating trans-ancestry genetic correlation with unbalanced data resources},
author = {Bingxin Zhao and Xiaochen Yang and Hongtu Zhu},
journal= {arXiv preprint arXiv:2203.12154},
year = {2022}
}
备注
25 pages, 4 figures