理解群体结构校正回归
应用统计
2022-08-26 v1 定量方法
统计方法学
摘要
尽管针对复杂性状的全基因组关联研究(GWAS)已取得巨大成功,当前主流 GWAS 方法仅简单地对每个遗传变异分别检验每个基因型—表型关联。值得注意的是,当考虑全体遗传变异的联合模型时,使用这些方法的统计性质尚属未知。在此我们推进 GWAS 中对“群体结构校正”(PSC)方法——GWAS 中一种标准单变量方法——统计性质的理解。我们进一步提出并分析了 PSC 方法的一种校正,称为“校正群体校正”(CPC)。结合理论结果,数值模拟表明 CPC 始终与 PSC 相当或更优,且在某些特殊情况下有显著改进。
引用
@article{arxiv.2108.05655,
title = {Understanding the population structure correction regression},
author = {The Tien Mai and Pierre Alquier},
journal= {arXiv preprint arXiv:2108.05655},
year = {2022}
}