关于脉冲与双波混合模型下混合片段长度及祖先比例分布的注记
种群与进化
2015-09-22 v1
摘要
混合群体由两个或多个祖先群体合并形成，混合基因组中每个位点的祖先来自任一来源。考虑一个简单的“脉冲”混合模型，其中群体A和B在t代前合并，无后续基因流。我们推导了混合染色体中具有A（或B）祖先的比例的分布，作为染色体长度L、t和A来源初始贡献m的函数。我们证明这些结果可用于混合参数的推断。对于更复杂的混合模型，我们推导了祖先比例分布在拉普拉斯空间中的表达式，其依赖于每种祖先片段长度的分布。我们得到了“双波”混合模型特例的显式结果，其中群体A在当前与初始混合事件之间的某一世代贡献了额外的迁移者。具体而言，我们推导了A和B片段长度分布的公式，以及祖先比例分布的数值结果。我们表明，对于近期混合，在双波模型下生成的数据几乎无法与脉冲模型下生成的数据区分。
引用
@article{arxiv.1509.05904,
title = {A note on the distribution of admixture segment lengths and ancestry proportions under pulse and two-wave admixture models},
author = {Shai Carmi and James Xue and Itsik Pe'er},
journal= {arXiv preprint arXiv:1509.05904},
year = {2015}
}
备注
12 pages, 3 figures