估计混合种群起源的层次贝叶斯方法
应用统计
2008-12-18 v1 统计方法学
摘要
我们提出了一种层次贝叶斯模型，用于估计源种群对新建立种群的贡献比例。样本取自新建立种群的第一代后代，但交配可能优先发生在来自同一源种群的迁移个体之间。利用新建立种群和源种群的基因型来估计混合比例，并将这些混合比例与可能影响定殖过程的环境和人口统计因素联系起来。我们在单一的层次模型中估计了选型交配系数、混合比例以及环境因素与混合比例之间的回归关系。新建立种群中基因型的第一阶段似然函数是反映定殖过程的混合多项分布。环境和人口统计数据通过层次先验结构纳入模型。我们进行了一项模拟研究，通过使用不同水平的种群分歧和分析中包含的遗传标记数量来调查模型的性能。我们使用马尔可夫链蒙特卡洛 (MCMC) 模拟对模型参数的后验分布进行推断。我们将该模型应用于源自苏格兰奥克尼群岛灰海豹的数据集。我们将我们的模型与先前用于分析这些数据的类似模型进行了比较。模拟结果和实际数据应用结果表明，我们的模型为协变量效应提供了更好的估计。
引用
@article{arxiv.0805.3269,
title = {A hierarchical Bayesian approach for estimating the origin of a mixed population},
author = {Feng Guo and Dipak K. Dey and Kent E. Holsinger},
journal= {arXiv preprint arXiv:0805.3269},
year = {2008}
}
备注
Published in at http://dx.doi.org/10.1214/074921708000000174 the IMS Collections (http://www.imstat.org/publications/imscollections.htm) by the Institute of Mathematical Statistics (http://www.imstat.org)