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基因渗入在推断的有效种群大小历史中引发波动

种群与进化 2017-03-29 v1

摘要

人类种群具有复杂的基因渗入历史和不断变化的种群大小。人类遗传变异受这两个过程的影响,因此对过去种群大小的推断取决于过去种群间的基因流和基因渗入模式。从遗传学推断出的人类种群历史中一个显著方面是,在过去 100,000 年的瓶颈和扩张之前,存在一个一致的较大有效种群大小的“波动”。在此,我进行了一系列模拟,以研究来自遗传分化祖先种群的基因渗入和基因流如何影响对祖先有效种群大小的推断。来自已灭绝的、遗传分化的种群的基因渗入和基因流,均会在推断的有效种群大小历史中持续产生波动。该波动的时间和幅度反映了遗传分化的祖先种群的起源时间以及基因渗入或基因流的强度。这些结果表明,即使是来自古老种群的少量基因渗入或基因流,也可能对有效种群大小的推断产生重大影响。

关键词

引用

@article{arxiv.1703.09564,
  title  = {Introgression makes waves in inferred histories of effective population size},
  author = {John Hawks},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1703.09564},
  year   = {2017}
}

备注

38 pages, 7 figures