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适应模型中的集体涨落

种群与进化 2015-06-30 v1 统计力学 生物物理

摘要

适应的动力学难以预测,因为即使在大种群中它也高度随机。这种不确定性来自数量波动(称为遗传漂变),该波动产生于种群中特别适合的子代个体的小数目中。这一进化先锋中的随机遗传漂变也限制了适应速度,而在忽略这些偶然效应的确定性模型中该速度发散。已经开发了几种方法来分析噪声对适应预期动力学的关键作用,包括整个种群的平均适合度,或新出现的有益/有害突变的命运。然而,关于遗传漂变如何在种群水平上引起波动(包括适合度分布变异和速度变异)却知之甚少。然而,这些现象控制了实验进化实验的可重复性,并且是真正预测性理解进化过程的关键。在此,我们通过计算和解析方法的结合发展了一种针对这些涌现涨落的精确方法。我们解析地证明,通过适当选择动态约束,矩方程的无限层级可在任意阶闭合。该约束调节(而非固定)种群大小,从而考虑资源限制。所得线性方程式可数值精确求解,表现出涨落诱导项,其放大短距离关联并抑制长距离关联。重要的是,通过考虑亚种群的动力学,我们提供了通向关键种群遗传量(如固定概率和遗传多样性衰减率)的系统性路径。

关键词

引用

@article{arxiv.1506.08683,
  title  = {Collective Fluctuations in models of adaptation},
  author = {Oskar Hallatschek and Lukas Geyrhofer},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1506.08683},
  year   = {2015}
}