具有偏斜后代分布的二倍体种群的祖先重组图

我们研究了一个Moran型的大后代数二倍体双亲多位点种群模型。在每个时间步，随机均匀抽取一对二倍体个体为种群贡献后代。后代数可能相对于总种群规模很大。最近多位作者考虑了类似的“严重偏斜”繁殖机制。每个二倍体亲本个体恰好贡献一条染色体给每个二倍体后代，因此祖先谱系只能在不同的个体中合并。因此观察到时间尺度分离现象。将Möhle (1998)的一个结果推广，得到祖先过程收敛到一个必然允许祖先谱系同时多重合并的祖先重组图。当亲本每次只贡献一个后代时，通常的祖先重组图作为我们模型的特例获得。由于二倍性和大后代数，出现了新效应。例如，每个位点的边缘谱系允许最多四个组的同时多重合并，并且即使重组率很大，不同位点仍保持显著相关。因此，同一染色体上相距很远的位点的谱系保持相关。推导了两个位点的合并时间相关性，并表明它是我们模型合并参数的函数。扩展Eldon和Wakeley (2008)的观察，连锁不平衡的预测被证明除了重组率外，还是我们模型繁殖参数的函数。即使重组率高且样本量大，位点间合并时间比率的相关性也可能很高。