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染色体着色:重组如何混合祖先颜色

概率论 2022-01-19 v4 种群与进化

摘要

我们考虑一个单倍体种群规模为NN的带重组Moran模型。在每次出生事件中,以概率1ρNR1-\rho_N R后代复制某一亲本的染色体,以概率ρNR\rho_N R她继承一条由两个亲本染色体拼成的嵌合染色体。假设在时刻00每个个体的染色体被着以不同颜色,我们研究当考察染色体的一段使得ρ:=limNρNN2\rho := \lim_{N\to \infty} \frac{\rho_N N}{2}\to \infty时,在大规模种群中渐近固定的染色体的颜色划分。为此,我们沿时间回溯追踪随机抽样个体的染色体祖先。这给出一个取值于半直线颜色划分的马尔可夫过程,由Esser等人(2016)引入,其中块可合并与分裂,称为划分过程。其平稳分布与我们带重组的Moran模型中固定的染色体密切相关。我们能够在ρ1\rho \gg 1时给出该平稳分布的近似及误差界。这使我们证明划分最左块(即携带与0相同颜色的染色体区域)的(重整化)长度分布收敛于指数分布。此外,该块的几何可由具有显式强度测度的泊松点过程描述。

关键词

引用

@article{arxiv.1807.09116,
  title  = {Chromosome Painting: how recombination mixes ancestral colors},
  author = {Amaury Lambert and Verónica Miró Pina and Emmanuel Schertzer},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1807.09116},
  year   = {2022}
}