染色体着色:重组如何混合祖先颜色
概率论
2022-01-19 v4 种群与进化
摘要
我们考虑一个单倍体种群规模为的带重组Moran模型。在每次出生事件中,以概率后代复制某一亲本的染色体,以概率她继承一条由两个亲本染色体拼成的嵌合染色体。假设在时刻每个个体的染色体被着以不同颜色,我们研究当考察染色体的一段使得时,在大规模种群中渐近固定的染色体的颜色划分。为此,我们沿时间回溯追踪随机抽样个体的染色体祖先。这给出一个取值于半直线颜色划分的马尔可夫过程,由Esser等人(2016)引入,其中块可合并与分裂,称为划分过程。其平稳分布与我们带重组的Moran模型中固定的染色体密切相关。我们能够在时给出该平稳分布的近似及误差界。这使我们证明划分最左块(即携带与0相同颜色的染色体区域)的(重整化)长度分布收敛于指数分布。此外,该块的几何可由具有显式强度测度的泊松点过程描述。
引用
@article{arxiv.1807.09116,
title = {Chromosome Painting: how recombination mixes ancestral colors},
author = {Amaury Lambert and Verónica Miró Pina and Emmanuel Schertzer},
journal= {arXiv preprint arXiv:1807.09116},
year = {2022}
}