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精度与优势性:重新评估准稳态近似的有效性

化学物理 2025-04-16 v2 动力系统 定量方法

摘要

标准准稳态近似在Michaelis-Menten反应机理中的应用是生物化学模型约简的教科书例子,使用奇异摄动理论推导。然而,确定决定标准准稳态近似有效性的具体生化条件仍然是一项具有挑战性的工作。新兴研究表明,标准准稳态近似的精度随着初始酶浓度e0e_0与Michaelis常数KMK_M之比的减小而提高。在这项工作中,我们检查了这个比率及其对标准准稳态近似与其他邻近准稳态约简相比的精度和有效性的影响。使用常微分方程分析的标准工具,我们表明,虽然e0/KMe_0/K_M提供了标准准稳态近似渐近精度的指示,但标准准稳态近似的优势依赖于e0e_0与Van Slyke-Cullen常数KK的小比率。这里,我们将准稳态约简的优势定义为当它在具有重叠有效性条件的其他已知约简中提供最高近似精度时。我们得出结论,e0/Ke_0/K的大小提供了标准准稳态近似有效性的最准确度量。

关键词

引用

@article{arxiv.2501.06406,
  title  = {Accuracy versus Predominance: Reassessing the validity of the quasi-steady-state approximation},
  author = {Kashvi Srivastava and Justin Eilertsen and Victoria Booth and Santiago Schnell},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2501.06406},
  year   = {2025}
}

备注

30 pages, 6 figures