什么驱动淀粉样分子组装成寡聚体和原纤维？
软凝聚态物质
2015-05-19 v1
摘要
我们发展了一个关于淀粉样肽三种平衡态（单体、寡聚体和原纤维）的通用理论。我们假设寡聚体状态是一种无序的类胶束集合体，由少数几条肽链通过疏水相互作用松散地结合在一起，形成球状疏水核心。我们假设原纤维状淀粉样链是排列整齐的，并通过“拉链式”相互作用——氢键和空间堆积，以及特定的疏水侧链接触——进一步稳定。该模型做出了一系列与实验一致的广泛预测：(i) 类似于表面活性剂胶束化，淀粉样寡聚化应随本体肽浓度增加而增加。(ii) 原纤维化的起始限制了溶液中寡聚体的浓度。(iii) 平均原纤维长度与单体浓度的关系与α-突触核蛋白的数据一致。(iv) 完整的原纤维长度分布遵循α-突触核蛋白的分布。(v) 变性剂应“熔化”原纤维。(vi) 添加盐应通过减少淀粉样肽链之间的排斥力来稳定原纤维。有趣的是，溶剂条件的微小变化可以：(a) 改变寡聚体和原纤维之间的平衡，以及(b) 通过影响过渡态能垒引起速率的巨大变化。该模型可能为理解淀粉样疾病背后的物理过程提供有用的见解。
引用
@article{arxiv.1007.5332,
title = {What drives amyloid molecules to assemble into oligomers and fibrils?},
author = {Jeremy Schmit and Kingshuk Ghosh and Ken Dill},
journal= {arXiv preprint arXiv:1007.5332},
year = {2015}
}